人物经历
2013年晋升为讲师,2014年破格晋升为副教授。近五年发表SCI论文22篇,累积影响因子超过100,单篇最高影响因子9.202 (4篇),近五年发表的SCI论文累积引用次数超过150。主持国家自然科学基金青年项目、于维汉院士杰出青年基金、哈尔滨科技创新人才研究专项(青年后备人才)、中国博士后特别资助等多项课题的研究工作,作为学术骨干参加973计划和863计划项目各1项。担任国家自然科学基金(重大研究计划)通讯评审专家,担任Molecular Biology Reports、PLoS One、Mutagenesis等多个杂志审稿人。2014年受邀在“第六届全国生物信息学与系统生物学学术大会”上作专题报告,获优秀报告一等奖。自2008年起师从李霞教授从事生物信息学领域的学习和研究工作,主要研究方向为恶性肿瘤相关的非编码RNA识别、microRNA和lncRNA相关遗传多态研究、非编码RNA相关生物网络的构建以及生物信息学软件开发等。目前已开发了10个生物学软件和数据库,代表性数据库Lnc2Cancer、LincSNP得到超过40个国家5000余次访问,研究成果受到《Nature Reviews Genetics》、《Nature Reviews Endocrinology》等国际著名期刊的多次引用和评论。
工作经历
1、200309-200807:哈尔滨医科大学生物信息学院 本科生
2、200809-201307:哈尔滨医科大学生物信息学院 博士生
3、201307-201409:哈尔滨医科大学生物信息学院 讲师
4、201409-:哈尔滨医科大学生物信息学院 副教授
著作译著
1、生物信息学,李霞,人民卫生出版社,201003 |
2、生物信息学理论与医学实践,李霞,人民卫生出版社,201301 |
3、生物信息学,李霞,人民卫生出版社,201401 |
成果论文
1、Lnc2Cancer: a manually curated database of experimentally supported lncRNAs associated with various ,Nucleic Acids Research,2016年1月;44(D1):D980-5,第一作者 |
2、Construction of lncRNA-mediated feed-forward loop network reveals global topological features and pr,Oncotarget,2016年6月;doi:10.18632/oncotarget.10004,第一作者 |
3、Identification of lncRNA-associated competing triplets reveals global patterns and prognostic marker,Nucleic Acids Research ,2015年4月;43(7):3478-89,并列一作 |
4、A novel re-annotating strategy for dissecting DNA methylation patterns of human long intergenic non-,Nucleic Acids Research ,2015年4月;42(13):8258-70,并列一作 |
5、A global map for dissecting phenotypic variants in human lincRNAs,Eur J Hum Genet ,2013年10月;21(10):1128-33 ,第一作者 |
6、SNP@lincTFBS: a database of polymorphisms in transcription factor binding sites of human lincRNAs,Plos One,2014年1月;doi: 10.1371/journal.pone.0103851,第一作者 |
7、LincSNP: a database for linking phenotype-associated SNPs to human large intergenic non-coding RNAs,BMC Bioinformatics,2014年5月;doi: 10.1186/1471-2105-15-152,第一作者 |
8、miRSponge: a manually curated database for experimentally supported miRNA sponges and ceRNAs,DATABASE,2015年9月;doi: 10.1093/database/bav098,通讯作者 |
9、Identification of a core miRNA-pathway regulatory network in glioma by therapeutically targeting miR,Plos One,2014年7月;doi: 10.1371/journal.pone.0101903,并列一作 |
10、mirTarPri: improved prioritization of microRNA targets through incorporation of functional genomics ,Plos One,2013年1月;doi: 10.1371/journal.pone.0053685,并列一作 |
获奖记录
1、2013年博士研究生国家奖学金,教育部,第一,201309 |
2、2014年“第六届全国生物信息学大会”报告,教育部,一等奖,201406 |
3、2014年校级教师讲课大赛,哈尔滨医科大学,二等奖,201408 |
4、2015年校级优秀本科生毕业论文指导教师,哈尔滨医科大学,第一,201506 |
5、2015年全国数学建模竞赛,中华人民共和国教育部,一等奖,201509 |
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